Hilfe & FAQ

Wie sollen die Proben verschickt werden?

• Immer auf Trockeneis!

Wieviel RNA wird benötigt?

• Total RNA mit rRNA-Depletion: ~ 1 µg
• Total RNA für die mRNA Anreicherung mit Oligo-dT-Fängerkügelchen: ~ 100 ng (ggf. auch nur 10 ng bei hoher Qualität)
• Total RNA von ultra low input Proben: ~ 10 pg - 10 ng (siehe auch SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing)

Für welche Organismen gibt es Lösungen für die rRNA Depletion:

• Illumina TruSeq Stranded Total RNA Gold:  human, Maus, Ratte
• Illumina TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin (Globin mRNA inkl. rRNA Depletion): human, Maus, Ratte
• siTOOLs Biotech Pan-Prokaryote riboPOOL: Bakterien / Archaea

Tipps zum Arbeiten mit RNA:

• Tragen von „frischen“ Einmalhandschuhen
• Säuberung des Arbeitsplatzes und der Arbeitsgeräte (Pipetten, …) mit Reinigungslösungen wie z.B. RNaseZAP, RNase Away, …
• Räumliche Trennung des Arbeitsplatzes für RNA-Arbeiten von Arbeitsplätzen an denen mit RNase gearbeitet wird
• Verwendung von sterilen Filter-Pipettenspitzen
• Verwendung von sterilen Einwegkunststoffen sowie von DEPC-behandelten Reagenzien und Glaswaren
• Protokolle zügig durchführen mit kurzen Inkubationszeiten auf Eis und die Reaktionsgefäße so oft als möglich geschlossen halten
• wenn möglich Verwendung von Nuklease-freiem Wasser (DEPC-behandelt oder DNase/RNase-frei)
• Lagerung von RNA bei -80°C in Nuklease-freiem Wasser (bis zu 1 Jahr)
• Link:  “The Do's and Don'ts of Working with RNA”